לשון המכילתא דרבי ישמעאל בא - מסכתא דפסחא פרשה יח:
"קדש לי והיה כי יביאך שמע והיה אם שמוע כותבן כסדרן, ואם לא כותבן כסדרן הרי אלו יגנזו".
ר"ת מפרש אסדר הכתיבה, שהרי לשיטתו אינן מונחות בבתים כסידרן.
אך לרש"י ורמב"ם מדובר על סדר הנחתן בבתים.

ולהדיא דעת שו"ת הר"ן סימן לט:
"{מהירושלמי}: 'ספרים שכתבם כתפילין ומזוזות אין תולין בהם תפילין ומזוזות שכתבם כספרים תולין בהם', כלומר האי דלא קתני במתניתין אין בין לענין תלייה לפי שמה שתולין בספרים ואין תולין בתפילין ומזוזות אינו מחומר תפילין ומזוזות ולא מקולן של ספרים אלא מפני דרך כתיבתן אמרו כן לפי שהספרים כתיבתם גסה ויש ריוח הרבה בין שיטה לשיטה תולין אבל תפילין ומזוזות מתוך שכתיבתם דקה אין תולין, ולפיכך תפילין ומזוזות שכתבם כספרים תולין בהם וספרים שכתבן כתפילין ומזוזות אין תולין בהן".

ראיה נוספת לדבריו ממסכת מנחות דף מב ע"ב: "תפילין יש להם בדיקה, ואין ניקחין אלא מן המומחה". ופירש הרמב"ם הלכות תפילין ומזוזה וספר תורה פרק ב הלכה י: "הלוקח תפילין ממי שאינו מומחה צריך לבדקן". הרי שלא חשש שמא כתבן שלא כסדרן כגון שכתב ד' במקום ה' ותלה רגלה אח"כ.
וא"ת ולדידך למה לא חיישינן שלא קידש את השם? וי"ל דכו"ע רואים שיש פה שם, ודי באמירה בפה בתחילת הספר.