מן התנאים בדור חורבן הבית. יתכן כי הוא הקרוי ר' נחוניא הגדול. כפי הנראה היה קרוב לתלמידי רבן יוחנן בן זכאי.
רק מעט מדבריו בהלכה נשתמרו, ויש כמה מאמרי אגדה בשמו. ומפורסמת תפילתו בכניסה לבית המדרש. ומסופר (ראה במגילה כח, ב) על מדותיו הטובות וענוותנותו.
לר' נחוניא מיוחס פיתוח שיטת מדרש ההלכה בכלל ובפרט, ור' ישמעאל, תלמידו הגדול, נחשב כממשיכה של שיטה זו.
לר' נחוניא מיוחס גם ספר הבהיר, מדרש בדרך הקבלה, וכן מיוחסת לו תפילת "אנא בכוח".
קנה הוא שם עיר בנחלת אשר (יהושע יט, כח) ואולי נקרא על שם מקומו.
(באדיבות מרכז שטיינזלץ)